在一个融合宝可梦元素与神话体系的奇幻世界，各界原本和谐共生。然而，被封印的超级大boss——混沌邪尊复苏，其邪恶力量打破平衡，意图以黑暗统治世界。天庭、道教、截教、人教、妖族、佛教虽各有矛盾，但面对此威胁，也暗中有所动作。宝可梦与人类共同生活，拥有神奇能力。主角孙逸，立志成为宝可梦图鉴大师，因一次机缘巧合，卷入这场拯救世界的冒险。